PCR
●高速PCR
延伸时间设为1秒即可扩增1kb的片段,10kb以内延伸速度为5秒/kb,高于10kb的片段设为10秒/kb,缩短延伸时间可大幅提高PCR实验的总耗时。 |
●简便
除了引物和模板之外的PCR组分都包含在预混液中,简化了配液流程,同时也提高了实验的可重复性。此外,包含电泳指示剂的KOD OneTM PCR Master Mix –Blue-(Code No. KMM-201)可以在PCR反应完成后直接点样,无需另外添加Loading Dye。
●超高的保真性
保真性约为Taq DNA 聚合酶的80倍,保持了KOD系列产品中保真性最高的水准
●粗样品也可高效扩增(实验例2)
●可以使用含肌苷(dI)或尿嘧啶(dU)的引物和模板(实验例5)
1. 高速PCR实验
以人基因组DNA为模板,可进行超快速PCR扩增。结果显示,KOD OneTM PCR Master Mix及KOD OneTM PCR Master Mix -Blue-扩增1 kb以下的目的片段时延伸时间设为1 sec.,1 ~10 kb的目的片段时按5 sec./ kb设定可以得到清晰的扩增条带。
2.粗样品扩增
使用KOD OneTM PCR Master Mix,比较从血液、鼠尾裂解液(碱裂解液)分别扩增人β-globin基因和小鼠Thy-1基因结果。反应根据各PCR酶推荐条件进行,延伸时间5 sec./ kb。
结果显示,只有KOD OneTM PCR Master Mix能够得到明确的条带。
3.逆转录反应液(cDNA)的添加量对扩增的影响
逆转录反应液中残留的RNA对PCR有抑制作用,过量添加cDNA模板会使扩增效果变差。KOD OneTM PCR Master Mix不易受RNA的抑制作用。为了确认可引入的cDNA的量,通过加入不同量的cDNA模板,检测扩增TFR基因的效果。与原来的产品及其他公司的产品相比,即使添加较多的cDNA也能得到良好的扩增。
实验例8:哺乳动物细胞用表达载体中重组基因序列的3个碱基突变导入
实验例11:高GC模板 mouse c-Maf cDNA全长扩增
实验例15:Aspergillus fumigatus flbC 基因缺失株的 PCR 基因分型
【KMM-101】
Master Mix 1mL ×5支
【KMM-201】
Master Mix(含染料) 1mL ×5支
灭菌蒸馏水X μl
KOD One PCR Maaster Mix25μl
各引物15pmoles each
模板1~50ng(Plasmid)
10~200ng(Genome DNA)
~750ng[RNA相当](cDNA)
~5μl(粗样品)
〈2步法循环〉*
98℃ 10sec.
68℃ 5~10sec./kb 25~45 cycles
〈3步法循环〉*
98℃ 10sec.
(Tm-5)℃ 5sec.
68℃ 1~10sec./kb 25~45 cycles
延伸时间请根据片段长度进行设定:
1~10 kb:5 sec./ kb
10 kb~:10 sec./ kb
〈Step down循环〉*
98℃, 10sec.
74℃, 1~10sec./kb 5 cycles
↓
98℃, 10sec.
72℃, 1~10sec./kb 5 cycles
↓
98℃, 10sec.
70℃, 1~10sec./kb 5 cycles
↓
98℃, 10sec.
68℃, 1~10sec./kb 15~25 cycles
*基本上以2步法循环进行。引物的Tm值低于68℃或用2步法循环未见扩增时,请试一下3步法循环。另外,扩增10kb以上的目的片段时,如果出现Long PCR片段或非特异条带及弥散,请试一下Step down循环。 ※Tm值采用最邻近法(Nearest Neighbor method)计算得到的值。
引物的Tm值以及扩增产物的Tm值计算请点击此处进入在线工具
尽可能使引物长度在25~35mer的范围(Tm>63℃)。
引物的GC含量在45~60%之间,5‘ 端GC含量在60~70%之间,3‘ 端GC含量在40~50%之间以提高扩增的特异性。
高GC或复杂样本请尝试在循环前增加预变性步骤(94℃ 2min)。