在制备cDNA时,分别使用一般Random primer和NSR(Not so random)primer,进行 rRNA混入率的比较。


【实验方法】


使用GenNext® RamDA-seqTM Single Cell Kit  [Code: RMD-101],
用试剂盒中包含的RT-RamDATM Primer Mix以及另售的NSR Primer Set for mouse [Code: NSR-102],由NIH3T3细胞抽取出的Total RNA (10pg、1ng),制备cDNA、双链DNA。然后使用Nextera XT DNA Library Preparation Kit制备文库,用illumina MiSeq进行测序。

【实验结果】


Total RNA量 10pg、1ng都是在使用 NSR Primer Set时,rRNA混入率较低。
使用NSR Primer,相比Random primer可以降低混入率。

建议NSR Primer Set for human (NSR-101)用于人类样品,NSR Primer Set for mouse(NSR-102)用于鼠类样品。




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